A.Visi dan Misi

Kementerian Agama Provinsi Kalimantan Timur memiliki Visi, yaitu :
Terwujudnya Masyarakat Kalimantan Timur yang Taat Beragama, Maju, Rukun, Cerdas, Mandiri dan Sejahtera Lahir Batin

Sedangkan Misi, sebagai berikut :

• Meningkatkan kualitas bimbingan, pemahaman, pengamalan dan pelayanan kehidupan beragama.
  
• Meningkatkan penghayatan moral dan etika keagamaan.
  
• Memperkokoh kerukunan umat beragama.
  
• Meningkatkan kualitas pendidikan agama dan keagamaan.
  
• Meningkatkan pelayanan dan penyelenggaraan ibadah haji.
  
• Memberdayakan umat beragama dan lembaga keagamaan.
  
• Meningkatkan tata kelola kepemerintahan yang akuntabel.
  

B. Program Kerja Kanwil Kementerian Agama
Beberapa program kerja yang dilakukan oleh Kantor Wilayah Kementerian Agama Provinsi Kalimantan Timur, guna pencapaian visi dan misi tersebut, sebagai berikut :

• Program penerapan kepemerintahan yang baik.
• Program peningkatan sarana dan prasarana aparatur negara.
• Program peningkatan pelayanan kehidupan beragama.
• Program peningkatan pemahaman, penghayatan dan pengamalan dan pengembangan nilai-nilai keagamaan.
• Program peningkatan kerukunan umat beragama.
• Program pendidikan anak usia dini.
• Program penyelenggaraan Wajib Belajar pendidikan dasar 9 tahun.
• Program penyelenggaraan pendidikan menengah.
• Program penyelenggaraan pendidikan non formal.
• Program peningkatan mutu pendidikan dan tenaga kependidikan.
• Program manajemen pelayanan pendidikan.
• Program peningkatan pendidikan agama dan pendidikan keagamaan.
• Program penguatan kelembagaan pengutamaan Gender dan Anak.